Konkursi auhindadeks on riiklikud rahalised preemiad, mis antakse välja eraldi põhikooli- ja gümnaasiumi astmes ning parimate tööde juhendajatele.  Vastava tasemega tööde olemasolul antakse välja preemiad ka erinevate valdkondade kategoorias.  2007. aasta konkursi auhinnafond on 50 000 krooni. Lisaks antakse välja mitmeid eriauhindu.

Konkursi gümnaasiumi astme I preemia võitjate seast valib konkursikomisjon Eesti esindajad iga-aastasele Euroopa Liidu noorte teadlaste konkursile, mis 2007. aasta septembris toimub Hispaanias, Valencias.  Euroopa konkursile on võimalik igal riigil saata maksimaalselt 3 tööd ja 6 autorit.

Euroopa konkursid on toimunud juba 18 aastat.  Sinna pääsevad ainult vastavatel riiklikel konkurssidel 1. preemia võitnud tööd. 
Eesti on olnud esindatud viimasel viiel konkursil:
2002 Viin - Liina Saar (Saaremaa Ühisgümnaasiumi vilistlane) - tulemuseks eripreemia 2-nädalane stipendium Norra rahvusvahelisse Arktika keskkonna uurimisjaama Svalbardis
2003 Budapest - Taavi Tillmann ning Mihkel Kree ja Aigar Vaigu (Hugo Treffneri Gümnaasiumi vilistlased)
2004 Dublin - Tanel Ainla (Viljandi Paalalinna Gümnaasium), Sven-Erik Enno ja Kaupo Mändla (Türi Gümnaasium)
2005 Moskva - Margus Niitsoo, Maarja Saar (Tallinna Reaalkool), Kaidi Karu ja Mari Sarv (Kohtla-Järve Järve Gümnaasium)
2006 Stockholm - Peeter Jürviste (Antsla Gümnaasium), Martin Silts (Saaremaa Ühisgümnaasium)

Lisainfo Euroopa konkursi kohta leiab Euroopa Komisjoni noorteadlaste veebilehelt.